Les microbiotes influencent la biologie et la physiologie humaine, y compris la nutrition, la fonction immunitaire, la fonction cérébrale et le développement. Les modifications des profils des communautés microbiennes sont associées à de nombreuses maladies chroniques, dont l’obésité, le syndrome métabolique, les maladies inflammatoires de l’intestin et la parodontite. A l’inverse, le métabolisme de l’hôte et ses pathologies peuvent également affecter les microbiotes.
Les trois équipes interagissent au sein d’un axe transversal, dans le but d’élucider ces relations dans le contexte des maladies métaboliques. Les objectifs sont notamment de faciliter l’identification de groupes bactériens candidats, communautés ou métabolites, influençant l’homéostasie intestinale et l’axe intestin-cerveau et intestin-foie. Plusieurs membres de l’unité sont spécialistes des bactéries anaérobies.